Debido a un problema en la versión 10.0 del software Quartus® II, la opción Habilitar el triple estado de entrada en los pines de configuración activa en la opción de modo de usuario en el panel de configuración del cuadro de diálogo Opciones de dispositivo y pin está desactivada para los dispositivos Cyclone® III, Cyclone® III LS, Cyclone® IV E, Stratix® III y Stratix® IV.
Para evitar este problema, puede habilitar esta opción agregando la siguiente asignación a su archivo de configuración de Quartus II (.qsf):
set_global_assignment -name TRI_STATE_SPI_PINS ACTIVADO
Está previsto que este problema se solucione en un futuro lanzamiento del software Quartus II.