Debido a un problema en el controlador de reinicio de software, cuando se aplica el restablecimiento en caliente, el LTSSM no pasa por todos los estados esperados al iniciar los restablecimientos en caliente.
Este problema se puede solucionar con el siguiente código de lógica blando en el archivo altpcie_rs_serdes.v cerca de la línea 526:
exits_r
Este problema se corrigió en Intel® Quartus® versión de software 14.0